MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alistipes shahii WAL 8301 draft genome

Total Repeats: 23269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_021030	CAAC	2	8	3087501	3087508	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19502	NC_021030	CG	4	8	3087560	3087567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19503	NC_021030	GGGCT	2	10	3087619	3087628	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
19504	NC_021030	CAT	2	6	3087639	3087644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19505	NC_021030	TCGAAT	2	12	3087755	3087766	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19506	NC_021030	ACT	2	6	3087785	3087790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19507	NC_021030	GC	3	6	3087815	3087820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19508	NC_021030	TTC	2	6	3087847	3087852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19509	NC_021030	TTC	2	6	3087880	3087885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19510	NC_021030	GTG	2	6	3087960	3087965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19511	NC_021030	CAA	2	6	3088080	3088085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19512	NC_021030	TTC	2	6	3088087	3088092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19513	NC_021030	TCG	2	6	3088105	3088110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19514	NC_021030	CGC	2	6	3088119	3088124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19515	NC_021030	TCG	2	6	3088130	3088135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19516	NC_021030	CTG	2	6	3088156	3088161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19517	NC_021030	CCG	2	6	3088185	3088190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19518	NC_021030	CATCGC	2	12	3088194	3088205	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19519	NC_021030	N	307	307	3088272	3088578	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19520	NC_021030	GGC	2	6	3088602	3088607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19521	NC_021030	ACG	2	6	3088622	3088627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19522	NC_021030	GCA	2	6	3088629	3088634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19523	NC_021030	GC	3	6	3088637	3088642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19524	NC_021030	CGG	2	6	3088686	3088691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19525	NC_021030	TGA	2	6	3088736	3088741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19526	NC_021030	CGTT	2	8	3088760	3088767	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19527	NC_021030	GAG	2	6	3088798	3088803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19528	NC_021030	GAG	2	6	3088855	3088860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19529	NC_021030	GC	3	6	3088879	3088884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19530	NC_021030	CGG	2	6	3088898	3088903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19531	NC_021030	TCG	2	6	3088999	3089004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19532	NC_021030	GCT	2	6	3089031	3089036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19533	NC_021030	GCT	2	6	3089069	3089074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19534	NC_021030	CTG	2	6	3089083	3089088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19535	NC_021030	TGG	2	6	3089101	3089106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19536	NC_021030	CCG	2	6	3089112	3089117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19537	NC_021030	CGCCT	2	10	3089122	3089131	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19538	NC_021030	GCTG	2	8	3089138	3089145	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19539	NC_021030	CCTCG	2	10	3089181	3089190	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19540	NC_021030	GTC	2	6	3089203	3089208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19541	NC_021030	CTT	2	6	3089301	3089306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19542	NC_021030	GCT	2	6	3089331	3089336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19543	NC_021030	CGC	2	6	3089337	3089342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19544	NC_021030	GAC	2	6	3089386	3089391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19545	NC_021030	GGGT	2	8	3089474	3089481	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
19546	NC_021030	CGG	2	6	3089496	3089501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19547	NC_021030	ACA	2	6	3089543	3089548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19548	NC_021030	ACA	2	6	3089552	3089557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19549	NC_021030	ACA	2	6	3089561	3089566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19550	NC_021030	TGG	2	6	3089606	3089611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19551	NC_021030	GCT	2	6	3089674	3089679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19552	NC_021030	ACG	2	6	3089756	3089761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19553	NC_021030	CGG	2	6	3089773	3089778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19554	NC_021030	TTC	2	6	3089783	3089788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19555	NC_021030	GTT	2	6	3089800	3089805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19556	NC_021030	CGT	2	6	3089814	3089819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19557	NC_021030	CGG	2	6	3089821	3089826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19558	NC_021030	CTG	2	6	3089852	3089857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19559	NC_021030	CCG	2	6	3089890	3089895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19560	NC_021030	GCT	2	6	3089965	3089970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19561	NC_021030	CTT	2	6	3089992	3089997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19562	NC_021030	GCG	2	6	3090045	3090050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19563	NC_021030	CGG	2	6	3090051	3090056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19564	NC_021030	TGC	2	6	3090117	3090122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19565	NC_021030	GCT	2	6	3090139	3090144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19566	NC_021030	AAC	2	6	3090176	3090181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19567	NC_021030	CGA	3	9	3090184	3090192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19568	NC_021030	CCG	2	6	3090202	3090207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19569	NC_021030	CGC	2	6	3090208	3090213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19570	NC_021030	CGC	2	6	3090215	3090220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19571	NC_021030	TCG	2	6	3090243	3090248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19572	NC_021030	CGC	2	6	3090304	3090309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19573	NC_021030	GCC	2	6	3090371	3090376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19574	NC_021030	GCT	2	6	3090379	3090384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19575	NC_021030	CTGG	2	8	3090415	3090422	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19576	NC_021030	GCC	2	6	3090435	3090440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19577	NC_021030	GCT	4	12	3090487	3090498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19578	NC_021030	CTA	2	6	3090520	3090525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19579	NC_021030	TCGC	2	8	3090530	3090537	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19580	NC_021030	GTC	2	6	3090547	3090552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19581	NC_021030	CTC	2	6	3090568	3090573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19582	NC_021030	CCG	2	6	3090667	3090672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19583	NC_021030	GAG	2	6	3090686	3090691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19584	NC_021030	CGA	2	6	3090700	3090705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19586	NC_021030	GT	3	6	3090832	3090837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19587	NC_021030	GCCC	2	8	3090905	3090912	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19588	NC_021030	ACT	2	6	3091094	3091099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19589	NC_021030	GGCGC	2	10	3091164	3091173	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19590	NC_021030	CGA	2	6	3091185	3091190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19591	NC_021030	CCG	2	6	3091195	3091200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19592	NC_021030	GCG	2	6	3091295	3091300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19593	NC_021030	CGC	2	6	3091343	3091348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19594	NC_021030	GTCGGC	2	12	3091360	3091371	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19595	NC_021030	CAG	2	6	3091446	3091451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19596	NC_021030	TGCGC	2	10	3091490	3091499	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19597	NC_021030	CGA	2	6	3091517	3091522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19598	NC_021030	CTT	2	6	3091548	3091553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19599	NC_021030	ACG	2	6	3091768	3091773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19601	NC_021030	CTC	2	6	3091857	3091862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19602	NC_021030	CTTT	2	8	3091925	3091932	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19603	NC_021030	AACG	2	8	3092024	3092031	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19604	NC_021030	CACG	2	8	3092064	3092071	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19605	NC_021030	CGTCGC	2	12	3092094	3092105	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19606	NC_021030	TTGA	2	8	3092126	3092133	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19607	NC_021030	CGG	2	6	3092222	3092227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19608	NC_021030	AT	3	6	3092266	3092271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19609	NC_021030	TTTCTT	2	12	3092321	3092332	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19610	NC_021030	CCG	2	6	3092389	3092394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19611	NC_021030	CGG	2	6	3092483	3092488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19612	NC_021030	AAAATC	2	12	3092493	3092504	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19613	NC_021030	TCT	2	6	3092517	3092522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19614	NC_021030	CACG	2	8	3092579	3092586	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19615	NC_021030	CGCT	2	8	3094086	3094093	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19616	NC_021030	CGA	2	6	3094121	3094126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19617	NC_021030	GAC	2	6	3094148	3094153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19618	NC_021030	CGA	2	6	3094167	3094172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19619	NC_021030	GCC	2	6	3094190	3094195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19620	NC_021030	CTG	2	6	3094290	3094295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19621	NC_021030	GCC	2	6	3094310	3094315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19622	NC_021030	CGGC	2	8	3094327	3094334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19623	NC_021030	CGG	2	6	3094409	3094414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19624	NC_021030	TTA	2	6	3094418	3094423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19625	NC_021030	GA	3	6	3094444	3094449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19626	NC_021030	AAACC	2	10	3094592	3094601	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
19627	NC_021030	CGC	2	6	3096119	3096124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19628	NC_021030	AGG	2	6	3096215	3096220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19629	NC_021030	N	945	945	3096225	3097169	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19630	NC_021030	T	7	7	3097182	3097188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19631	NC_021030	C	6	6	3097209	3097214	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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19634	NC_021030	CGG	2	6	3098618	3098623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19644	NC_021030	AAG	2	6	3099354	3099359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19652	NC_021030	CAA	2	6	3099661	3099666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19657	NC_021030	TTC	2	6	3099884	3099889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19664	NC_021030	TA	3	6	3100502	3100507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19665	NC_021030	A	7	7	3100534	3100540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19666	NC_021030	ACGG	2	8	3100718	3100725	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19667	NC_021030	GTCTT	2	10	3100869	3100878	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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19683	NC_021030	TGCG	2	8	3102812	3102819	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19684	NC_021030	TTG	2	6	3102964	3102969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19696	NC_021030	CGG	2	6	3105888	3105893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19735	NC_021030	TCC	2	6	3107969	3107974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19756	NC_021030	GT	3	6	3109250	3109255	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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